COVID y Datos Abiertos

Los datos abiertos en esta pandemia pueden ser una gran política pública que permitan generar conocimiento colectivo!

Desde que se inició la pandemia, hemos tenido muchas discusiones en torno al rol de los datos en esto. En muchos de nuestros países hemos visto un presión de diversos sectores por contar con mejor información, me refiero a la academia, la sociedad civil, la prensa y los ciudadanos. La discusión se ha dado en torno pedir mayores niveles de acceso por parte de diversos actores, y por otro lado la autoridad que se defiende habitualmente con el argumento de la privacidad, argumento muy válido por cierto, ya que se trata de datos muy sensibles de ls personas, pero creo que en algunos casos se ha extremado más allá de los razonable, más aún hoy existiendo múltiples métodos para garantizar dicha privacidad.

La respuesta que hemos tenido en la región en esta materia ha sido muy diversa, me gustaría mostrar tres ejemplos de aproximaciones muy diferentes, al menos cuando estamos estamos hablando de datos abiertos, sin pretender ser un análisis exhaustivo regional, muestra tres aproximaciones muy diferentes de la autoridad en materia de datos.

Chile

En el caso de Chile, la autoridad de Salud, me refiero al Ministerio de Salud ha manejado el tema de la información con una lógica de informes semanales (tres veces por semana), el cual es un documento en formato PDF que se sube al portal de dicho ministerio . Existe un consenso de que el acceso a datos ha sido parcial y entregado a tirones.

Esto ha llevado a que muchas instituciones y personas, tanto desde la academia , como la sociedad civil han reclamado por la calidad y cantidad de los datos disponibles, incluso llegando a solicitarlos por diferentes vías.

Algunos centros de estudios y académicos han tomado esos datos y los replican en plataformas más abiertas que permitan su análisis, un buen ejemplo de esto, es el visualizador de datos COVID de la Universidad Católica.

Pero también el reclamo se da por la falta de granularidad y el tipo de información que se publica. A ello además agregar que en el portal de datos abiertos del Gobierno de Chile no hay nada en la materia (busqué por Covid y por Coronavirus, con resultados similares)

Me avisan por interno que se ha publicado un portal con los datos emanados desde el Ministerio de Salud, el cual corresponde básicamente a un repositorio con algunas visualizaciones y los informes del Ministerio de Salud (en pdf).

Además existe un repositorio en Github desarrollado por el Ministerio de Ciencia que contiene los datos del Ministerio de Salud en formatos abiertos (CSV y Json), como ya lo han expresado algunos académicos no es información y datos suficientes, ya que se trata de transcripción y procesos de scraping de los datos oficiales, como lo explica el mismo repositorio, pero no cumplen con la completitud ni granularidad necesarias.

Colombia

En el caso de Colombia, han establecido un portal de visualización de datos, en el cual se muestran muchas estadísticas y gráficas, se ve un gran esfuerzo por mostrar los datos en forma simple y accesible.

Adicionalmente el portal permite realizar filtrado y análisis con los datos crudo, tanto dentro del portal como exportarlos.

El portal también analizar online (como lo muestra el ejemplo), pero también permite exportar la data en diversos formatos (XML, CVS, Json y otros), para poder analizarlos localmente.

México

En el caso de México la autoridad de salud en esta materia, esto es, Sistema de Vigilancia Epidemiológica de Enfermedades Respiratoria Viral, al cual informan las 475 unidades monitoras de enfermedad respiratoria viral en todo el país de todo del sector salud, ha generado un archivos de datos (dataset) y lo publica en el portal de datos abiertos de dicho país.

El dataset se establece en función del diagnóstico clínico de ingreso un centro de salud, se considera como un paciente ambulatorio u hospitalizado. La base no incluye la evolución durante su estancia en las unidades médicas, a excepción de las actualizaciones a su egreso por parte de las unidades de vigilancia epidemiológica hospitalaria o de jurisdicciones sanitarias en el caso de defunciones.

El portal de datos permite descargar un archivo en formato CSV con registros unitarios a nivel de pacientes, los cuales han sido anonimizados y con muchos de sus atributos (fechas de eventos, grupo étnico, algunos datos de salud previa, edad, lugar de origen, entubado, permanencia en UCI y otros)

Es precisamente con este archivo, es que un académico asociado del Departamento de Ciencias de la Computación de la Universidad de Chile e investigador del Instituto Milenio Fundamento de los Datos, me refiero a Jorge Perez, pudo hacer un análisis del tiempo promedio transcurrido entre los primeros síntomas y el fallecimiento, lo cual no se puede hacer con los datos publicados en Chile.

Hoy que nos enfrentamos a una pandemia sin precedentes, la colaboración de todos los sectores para entender el fenómeno y pensar conjuntamente en soluciones y políticas públicas es fundamental. Como ha sido demostrado en otras áreas de la enfermedad, me refiero a la producción de respiradores artificiales de bajo costo.

En la medida que expertos e investigadores puedan acceder a datos confiables y con un adecuado nivel de granularidad, cuidando la privacidad de las personas, la generación de conocimiento colectivo permitirá tomar mejores decisiones frente a un fenómeno desconocido.

Foto de Markus Spiske en Pexels